Stardate 50425.1   Le Voyager est envahi par un macrovirus extraterrestre, une forme de vie inconnue gélatineuse qui attaque l'équipage dépassé et met le vaisseau hors service .Le Capitaine Janeway doit faire face au virus et le combattre, errant à travers les couloirs sombres du vaisseau en panne pour contrecarrer l'assaut extraterrestre. Pendant ce temps, le Docteur part pour sa première mission extérieure dans une colonie minière Garan pour localiser la source de cette mystérieuse et dangereuse infection virale.